El programa de Postgrado en Química que inició en 1974 con estudios conducentes a Magister en Química quedó reglamentado mediante la Resolución 055 de Abril 17 de 1989 del Consejo Superior, la cual establece que el Postgrado en Química estará conformado por los programas académicos de Maestría y Doctorado en Ciencias Químicas. El ICFES autorizó el funcionamiento de la Maestría en Ciencias Químicas mediante el Acuerdo 269 de 1983 y ha sido acreditado recientemente.

De sus egresados se espera que puedan desempeñarse exitosamente en el campo investigativo, académico e industrial y así fortalecer el desarrollo científico-tecnológico que requiere el país como también contribuir al mejoramiento de la calidad docente e investigativa a nivel superior.